Путь к файлу канала в ImageJ

Предполагая, что rjp2tif команда возвращает путь к файлу в стандартном выводе, и вы хотите передать этот вывод в качестве обычного аргумента CLI другой команде, вас может заинтересоватьxargs команда. Но обратите внимание, что в общем случае вы можете столкнуться с некоторой проблемой, если путь к файлу содержит пробелы или около того:

Считайте аргументы, разделенные пробелом, вкладкой, новой строкой и концом файла, из стандартных входных данных и выполните указанную утилиту с ними в качестве аргументов.
Аргументы обычно представляют собой длинный список имен файлов (сгенерированный ls или find, например), которые передаются в xargs по трубе.

Поэтому в этом случае, предполагая, что каждый путь к файлу занимает только одну строку (что, очевидно, имеет место, если в целом есть только одна строка), вы можете использовать следующее NUL-основанный совет, основанный наtr команда.

Вот команда, которую вы получите:

rjp2tif /path/to/rjpeg | tr '\n' '\0' | xargs -0 open -a imagej

Примечание: У меня есть ОС GNU/Linux, поэтому не могли бы вы подтвердить, что она работает под macOS?

FTR, ниже приведен полный код оболочки, позволяющий протестировать два различных режима xargs: создание одной команды на аргумент строки (-n1), или одна команда со всеми аргументами строки за один раз:

$ printf 'one \ntwo\nthree and four' | tr '\n' '\0' | xargs -0 -n1 \
  bash -c 'printf "Run "; for a; do printf "\"$a\" "; done; echo' bash
Run "one " 
Run "two" 
Run "three and four" 

$ printf 'one \ntwo\nthree and four' | tr '\n' '\0' | xargs -0 \
  bash -c 'printf "Run "; for a; do printf "\"$a\" "; done; echo' bash
Run "one " "two" "three and four" 

######################################
# or alternatively (with no for loop):
######################################

$ printf 'one \ntwo\nthree and four' | tr '\n' '\0' | xargs -0 -n1 \
  bash -c 'printf "Run "; printf "\"%s\" " "$@"; echo' bash
Run "one " 
Run "two" 
Run "three and four" 

$ printf 'one \ntwo\nthree and four' | tr '\n' '\0' | xargs -0 \
  bash -c 'printf "Run "; printf "\"%s\" " "$@"; echo' bash
Run "one " "two" "three and four"